回應生策會/生策中心提出的「生醫政策總體檢-四篇十六條三十三項建言」-體制篇第三條第二項，「兩岸醫藥品合作專案推動辦公室」昨日(09/20)正式掛牌，對於行政院張善政政務委員以及衛生署邱文達署長在08/31記者會之後，展現決斷力與效率，真正看到產業的需求，以最快速度協調部會，按計畫期程「立即推動」成立兩岸專案辦公室，生會/生策中心表達謝意與肯定。

而針對TFDA新聞稿所指「近期就要和SFDA展開藥品研發合作專案計畫，就甄選專案之個案情況建立合作模式,加速新藥上市時程」，生策會/生策中心表示，TFDA將採ICH、GHTF作為選案標準，與過去生策會提出之合作模式相呼應，未來兩岸可在國際準則下啟動合作機制。對於目前產業已開始摩拳擦掌，為求搶得兩岸合作專案的頭香，生策會/生策中心也呼籲TFDA應立即對外辦理ICH/GHTF Guideline的說明會，來協助所有新藥研發及醫療器材業者在一致的資訊下，據以準備計畫書、了解ICH/GHTF的各項查核點，以及IND的送案規範、流程；此外，TFDA也應公開收案後的甄選審查流程，以及中選案件的獲選因由供外界明瞭，使產業有公平、公正、透明的甄選機制可依循。

生策會/生策中心表示，落實協議讓兩岸臨床合作是產業之期望，目前TFDA雖已啟動兩岸專案辦公室，然而兩岸醫藥合作的實質體現，關鍵仍有待大陸成立對應的機構，同步運作。因此，生策會/生策中心呼籲政府也應立即推動「生醫政策總體檢-四篇十六條三十三項建言」-體制篇第三條第一項建言，由衛生署、經濟部、陸委會整合、統一對大陸事務談判的窗口，以集中溝通力道、意見一致的促使大陸了解臨床合作的重要性，從而積極回應，進一步落實兩岸聯合人體試驗委員會、聯合臨床試驗病房、聯合臨床試驗查核小組、聯合新藥審議委員會，加速兩岸新藥合作開發時間表。