來源: 生策會編譯
Illumina 正式宣佈即將進軍空間轉錄體學（spatial transcriptomics），推出全新技術，協助研究人員分析細胞行為與其在複雜組織中的空間分布。
這項公告發布於 Advances in Genome Biology and Technology（AGBT） 年會前夕，屆時Illumina將展示更多技術細節與應用成果。此外，這也延續了該公司近期向蛋白質體學（proteomics）與單細胞分析（single-cell analysis）領域擴展的策略。
Illumina空間轉錄體學技術概述
- 兼容現有平台：新技術將適用於NextSeq和NovaSeq硬體，並透過全新的多模態分析（multimodal）軟體平台進行數據處理。
- 預計2026年全面商業化，屆時可提供每次實驗數百萬個細胞的分析能力，涵蓋50 mm × 15 mm的影像區域，並建立細胞間的鄰近性與交互作用圖譜。
- 非假設探索（hypothesis-free discovery）：技術目標是發掘新細胞類型與疾病驅動因子，例如腫瘤微環境中的未知調控因子，並應用於神經科學、免疫腫瘤學等領域。
- Illumina Connected Multiomics：新軟體平台將整合基因體學（genomics）、蛋白質體學（proteomics）、空間轉錄體學（spatial transcriptomics）、表觀遺傳學（epigenetics）及單細胞分析（single-cell analysis），提供更全面的多體學分析能力。
初步應用與研究合作
Illumina將於AGBT會議上展示早期使用者的研究成果，涵蓋肺纖維化、腫瘤組織變化及大腦發育等領域。
- 肺纖維化研究（TGen）
- 轉譯基因組研究所（Translational Genomics Research Institute, TGen）利用此技術研究肺纖維化（pulmonary fibrosis），發現並定位與上皮細胞重塑（epithelial cell remodeling）相關的分子失調現象。
- 目標：識別潛在治療標的，以抑制或減緩肺纖維化的進程。
- 腦組織三維重建（Broad Institute）
- 麻省理工學院（MIT）與哈佛大學Broad研究所利用該技術，在單一組織切片上完成10項實驗，用於建立小鼠大腦的三維重建模型。
- 研究價值：發掘新的標誌基因（marker genes），並在多個組織切片間同步驗證其表達模式。
- 前列腺癌研究（St. Jude兒童研究醫院）
- St. Jude兒童研究醫院空間體學中心（Center for Spatial Omics） 透過該技術，深入分析前列腺腫瘤組織的變化。
- 研究目標：透過空間體學（Spatial Omics）重建細胞結構與細胞外基質（extracellular matrix）分布，解析癌症進展的機制。
- 母鼠孕期大腦區域基因調控研究（Illumina）
- Illumina高級科學研究總監Darren Segale研究發現，孕期小鼠大腦內存在區域特異性（regionally distinct）基因調控機制，這些變化可能與母性行為（maternal behavior）相關。
結論：Illumina積極布局空間轉錄體學，推動多體學融合
- Illumina 透過整合空間轉錄體學與多體學技術，提供更精細的細胞與組織分析能力，有望加速疾病機制探索與新藥研發。
- 該技術不僅適用於腫瘤學，還可應用於神經科學、免疫學、纖維化疾病等領域，為精準醫學帶來革命性突破。
新聞來源: Illumina maps out entry into spatial transcriptomics
